顺治十八年辛丑（一六六一）春三月戊午（初九日），平西王吴三桂奏：平马乃土司，擒其酋龙吉兆。
乙丑（十六日），授浙江提督田雄二等侯、福建提督马得功三等侯。
夏四月乙酉（初六日），兵部遵旨议覆：『粤西接壤苗猺土司，诚属要地。都统线国安应以都统、太子少保、三等伯镇守广西，加征剿将军；总管定藩下官兵，再拨与绿旗官兵三千员名，驻扎桂林府。令广西提督杨遇明领广西提标兵六千赴广东，再于广东稍缓地方兵丁酌调一千，改为广东提督标兵；杨遇明以原衔充广东提督。杨遇明缺，应将广西左翼总兵官马雄升补；统原额兵五千，仍驻梧州。原任两广总督王国光应加镇海将军，拨八旗汉军兵二千；每翼副都统各一员、每旗参领二员、每参领下防御二员、骁骑校各一员，俱令携带家口，赴广东驻防。王国光、沈永忠、杨遇明应驻潮州等处要地，着会同平南王尚可喜及督、抚商榷具奏。至军机事务，亦公同酌议』。从之。
丙午（二十七日），以许世昌为福建巡抚（巡按江西御史内升侍郎）。
五月乙丑（十七日），广东巡抚董应魁奏：『逆渠邓耀窃踞廉州之龙门历有年所，抚之愈骄，频寇雷阳。臣与平南靖南二王、督臣商调官兵直捣龙门，荡其巢穴。邓耀远遁高趾，交趾发兵逆击，杀贼无算。邓耀削发窜匿粤西被获，应请正法』。下部知之。
六月戊寅朔，浙江提督田雄奏辞侯爵，兼请解提督任。得旨：『卿擒获福王投诚，功大。又随大兵攻战，劳绩甚多；镇守海疆，宣力有年。故特授侯爵，以示眷酬。宜祗遵成命，并殚忠猷，以副倚任；不必逊辞』。
癸卯（二十六日），福建巡抚徐永桢奏：『提督马得功剿平逆贼李月高、许于敬，其余党下海者皆掩杀无余』。下部察叙。
秋闰七月癸未（初六日），安南将军、内大臣达素奏：『据海澄公黄梧招抚郑芝龙属下伪都督万仪、万禄等擒伪中匡伯张进、伪总兵朱受，拆毁所据铜山城垣房屋，率伪官一百八员、兵四千四百名、兵民家口万余渡海来归』。得旨：『万仪、万禄等识时向化，倾心投诚；殊可嘉尚！着从优议叙。海澄公黄梧实心效绩，招徕有方；并着议叙』。
辛卯（十四日），谕吏部、兵部：『海寇入犯江南时，提督梁化凤奋勇效力，同满兵击败贼众；及贼奔窜往犯崇明，梁化凤星往应援，保全孤城，功亦不小。叙功时，授世袭阿达哈哈番，止足赏其江宁捷功。应再叙崇明捷功，加授世职，以示鼓励。至于崇明守城文武各官，坚心竭力，拒贼全城；深为可嘉！亦应各加世职，以示鼓励。俱着察明。从优议叙。彼时江南数百里内从贼者多，惟安庆固守城池，不肯从逆；亦属可嘉。守城各官，亦着察叙具奏』。
八月壬子（初六日），吏部遵旨议覆：『尹大器举首郑芝龙在狱私与逆子郑成功往来通信密行事款，鞫勘俱实；授拖沙喇哈番』。得旨：『尹大器，授拜他喇布勒哈番』。
戊午（十三日），谕户部：『前因江南、浙江、福建、广东濒海地方偪近贼巢，海逆不时侵犯，以致生民不获宁宇；故尽令迁移内地，实为保全民生。今若不速给田地、居屋，小民何以资生！着该督、抚详察酌给，务须亲身料理，安插得所，使小民尽沾实惠；不得但委属员草率了事。尔部即遵谕速行』。
九月丙戌（初十日），谕刑部：『近览尔部章奏，徐胜等被掳下海、旋经投归，仍按律拟罪。但念此辈先虽从贼，乃能不忘故土，乘间来归；着免罪。以后凡有此等投诚者，俱着免罪』。
兵部题：『铜山伪都督郭义、蔡禄、罗珰等率众投诚，应请议叙』。得旨：『郭义、蔡禄，俱授左都督，加太子太保；仍给三等阿思哈尼哈番，世袭八次。罗珰，授右都督；仍给三等阿达哈哈番，世袭四次』。
丁亥（十一日），调浙江总督赵国祚为山东总督、云南贵州总督赵廷臣为浙江总督。改四川陕西总督李国英为四川总督，以山西巡抚白如梅为陕西总督；改江南江西总督郎廷佐为江南总督，以江西巡抚张朝璘为江西总督。以贵州巡抚卞三元为云南总督、内秘书院学士刘清泰为河南总督。改广东广西总督李栖凤为广东总督，以广西巡抚于时跃为广西总督。
冬十月己酉（初三日），「海贼」郑芝龙并其子郑世恩、郑世荫等照谋叛律，族诛；郑芝豹当郑成功变叛时即投诚来归，并其子俱免死。
庚申（十四日），以浙江定海县舟山人民内徙，免其顺治九年至十二年逋赋。
康熙元年壬寅（一六六二）春正月甲午（二十日），平南王尚可喜奏：『逆贼萧国隆劫掠广、肇二府，臣遣兵水陆进剿，自顺治十八年八月至九月，平贼寨武定屯等一十三处。萧国隆穷迫，焚巢投水身死；擒杀贼党一千五百余人，获军器、船马无算。广、肇地方悉平』。下部议叙。
二月戊申（初四日），浙江总督赵国祚奏：郑逆下伪官柳会春等五十九人率众投诚。
庚午（二十六日），先是，平西大将军平西王吴三桂、定西将军内大臣公爱星阿等奉命征缅，两路进兵；于顺治十八年十一月初八日，会师木邦。伪晋王李定国先奔景线，伪巩昌王白文选遁据锡波，凭江为险，官兵自木邦昼夜行三百余里，临江造筏；将渡，白文选复奔茶山。吴三桂、爱星阿遣总兵官马宁等率偏师追之，自领大军直趋缅城。先遣人传谕缅酋，令执送伪永历朱由榔；否则，兵临城下，后悔无及。十二月初一日，大军至缅城；缅酋震惧，遂执朱由榔献军前，杀伪华亭侯王维恭等一百余人。总兵官马宁等追及白文选于猛养，白文选降；滇南平。十二月初十日，大军凯旋；吴三桂、爱星阿等汇疏上闻。得旨：『览王等奏，大兵进抵缅城，伪永历及其眷属全获无遗；伪巩昌王白文选逃奔茶山，大兵昼夜追及，白文选并伪官四百九十九员、兵丁三千八百余名、家口七千余名全军归降，获马象甚多。具见王等调度有方、将士同心戮力，克奏肤功；朕心深为嘉悦！在事有功官兵，着从优议叙』。
三月己亥（二十六日），遣官往浙江、福建、广东安辑投诚官民。
夏四月庚戌（初七日），福建总督李率泰奏：『定海小埕贼众盘踞，臣密会靖藩各调官兵击走之。又万安所先经迁毁，续被伪镇杨宣等筑垒新城；臣复密会提臣马得功调拨官兵夹剿，贼不能支，扬帆远遁』。下部知之。
五月癸未（十一日），谕礼部：『平西王吴三桂镇守秦、蜀、绥辑滇、黔，抚顺剿逆，茂着勋劳。伪永历朱由榔以明室遗孽煽集党羽，妄称尊号，窃据一隅；历年以来，屡烦王师征剿，疆圉弗宁。今王奉命统领满、汉大兵出边进讨，于顺治十八年十二月内直抵缅甸，擒伪永历及其眷属、又降伪巩昌王白文选并伪官全军；此皆王殚忠奋力，运筹谋略，调度有方，遂使国威远播，逆孽荡平，功莫大焉。宜加殊礼，以示眷酬。着进封为亲王；应行事宜，尔部察例具奏』。
辛丑（二十九日），平南王尚可喜奏：『总兵官许龙擒郑成功之弟郑成赐于厦门』。得旨嘉奖，下部议叙。
六月乙丑（二十四日），谕兵部：『京口水师船发往浙省定海，合浙省水师船，着设提督一员、总兵二员，驻扎定海。福建水师应设提督一员、总兵二员；此水师官兵应驻何处？每处应设官兵船若干？尔部会同大学士苏纳海、尚书车克速议秦闻』。
丙寅（二十五日），靖南王耿继茂奏：『海逆郑成功因其子郑锦为各伪镇所拥立、统兵抗拒，郑成功不胜忿怒，骤发颠狂，于五月初八日咬齿身死』。下部知之。
秋七月壬午（十一日），靖南王耿继茂奏：『漳州水师经制兵三千，原设游击二，分为二营；恐兵多不便约束，请增游击一，改为中、左、右三营』。从之。
冬十月己未（十九日），云南巡抚袁懋功奏：『据车里宣慰使刀木祷报称：伪晋王李定国逃奔景线，染病身死』。下部知之。
十一月甲戌（初四日），刑部等衙门以朝审情实各犯具奏，内绞犯卫正元一案得旨：『卫正元身为江南巡按，当海贼入犯时，理应前进保守江宁；乃由太平退回凤阳，本当处死。念其在世祖章皇帝时曾经摘发奸弊、纠参贪官卢慎言，今姑从宽免死，流徙尚阳堡』。
乙未（二十五日），靖南王耿继茂奏：『伪镇威将军左都督杨学皋率所属官兵三千余名、人民家口三万有余投诚，请从优议叙』。得旨：『览王奏，杨学皋率领官兵真心投诚，深可嘉尚！着议叙具奏。其归顺人民，听其自便安插』。寻授左都督，加太子太保，给三等阿思哈尼哈番。
十二月丁未（初八日），京口镇海将军刘之源奏：『伪肇敏将军陈文达拥兵海上十余年，今十月中统领舟师抵台受抚；又伪总兵罗永德脱身来归，呈缴伪印』。下部察叙。
己酉（初十日），靖南王耿继茂奏：『总兵官吴万福奉命招抚伪总兵王士鳌等归诚』。下部察叙。
癸丑（十四日），靖南王耿继茂奏：『自顺治十八年九月起、至康熙元年七月止，陆续绍抚伪将军、都督、总兵并副、参、游、守、千把总等官共二百九十员，兵共四千三百三十四名，家口共四百六十七名；请敕部酌议：各官给与衔俸、兵丁入伍支粮』。下部知之。
辛酉（二十二日），谕吏部、兵部：『贵州接壤云南，皆系岩疆要地；且苗疆杂居，与云南无二。其一切文武官员、兵民各项事务，俱着照云南例，令平西亲王管理』。
丁卯（二十八日），裁福建海澄总兵官。
命福建水师提督带兵四千，驻扎海澄县；左路水师总兵官带兵三千，驻扎闽安县；右路水师总兵官带兵三千，驻扎同安县。
康熙二年癸卯（一六六三）春二月壬寅（初三日），湖广提督董学礼奏：『前奉命会剿湖广西山巨寇李来亨、马腾霄、党守素等，随同郧阳总兵官穆生辉、襄阳总兵官于大海、辰常总兵官高守贵统领官兵三万人凿山关道，以正月初五日进至李家店，遇贼兵万余人；各路奋击，斩馘过半，生擒伪总兵宗段，获旗帜、器械无算，贼党焚巢遁走。又别遣夷陵镇将恢复归州、巴东、巫山等处，直达夔州；并抚辑各处洞寨』。得旨嘉奖，下部议叙。
丁未（初八日），陕西总督白如梅奏：『提督王一正率兴安总兵官于奋起、河北总兵官鲍敬进剿逆贼郝摇旗；至房县横水地方，伪罗军门将万余人拒战。大败之，杀贼兵无算，生擒贼一百七十三人徇于军，大获盔甲、器械』。下部察叙。
丁巳（十八日），兵部议准平西王吴三桂奏，请将云、贵二省总督、巡抚敕书撰入「听王节制」四字。从之。
戊午（十九日），授投诚伪侯陈豹为慕化伯，给三等伯俸。
庚申（二十一日），兵部议覆：『广东镇海将军王国光奏：总兵官许龙标下官兵夺获贼船，生擒伪都督邵应祚，杀贼八十余名，擒贼伙十三名；为数无多，例不议叙。应令该督酌量奖赏，以示鼓励』。得旨：『据奏官兵入海夺获贼船、生擒伪都督，尔部比照陆地以擒杀无多、不准议叙，不合；仍着议叙具奏』。
三月壬辰（二十四日），荷兰国遣出海王统领兵船至福建闽安镇助剿「海逆」，又遣其户部官老磨军士丹镇、总兵官巴连卫林等朝贡；上嘉之，各赐银、币有差。
夏四月辛丑（初四日），湖广总督张长庚奏：『提督董学礼同各镇将等由鱼刺坡进抵长坪，于三月初九、初十日大破逆贼李来亨，擒杀贼党；攻进双龙观、三白垭二关，逆贼焚巢遁走』，下部知之。
五月丁亥（二十日），湖广提督董学礼奏：『提镇各标将弁共招抚西山余党洞寨一百四处，缴到伪敕印一百六十余件』。下部知之。
六月乙卯（十九日），兵部议覆：『平西王吴三桂奏：李定国之子李嗣兴从边外投诚，缴伪册宝、印札、带领官弁兵丁家口一千二百余名、象马无算；应照例议叙』。得旨：『李嗣兴，着授都统品级；以下各官，从优再议』。
秋七月甲午（二十九日），湖广提督董学礼奏：『逆贼李来亨遁踞谭家寨，大兵四面围守；六月二十七日五鼓，大雾，贼乘势突出，分犯塘汛。各镇标兵夹击，斩首七百六十五级，生擒七十三名』。得旨：『事平察叙』。
八月己酉（十四日），靖南王耿继茂奏：『伪尚书参知军政事蔡雷鸣委曲开导海寇向化之路，密令其子伪侍郎蔡协吉、伪通政蔡源等携眷来归，真心效顺；应请叙录』。下部议。
庚戌（十五日），福建投诚伪同安伯郑鸣骏奏报：『伊兄郑泰集众投诚，为侄郑锦设计羁留，投缳自经；遗命子郑缵绪统所部文武各官四百余员、水陆兵丁七千三百余名，各带家眷驾舟舰一百八十余号直抵泉郡港口投诚，并缴伪敕印等件』。上深嘉之，下部议叙。
甲寅（十九日），以流贼余孽郝摇旗、刘体纯、李来亨等窜伏郧襄山中，猖獗梗化；命都统穆里玛为靖西将军、都统图海为定西将军，同都统辅国公宗室穆琛、护军统领孙达里、都统觉罗巴尔布、护军统领科尔昆统兵往剿。
乙卯（二十日），浙江巡抚朱昌祚奏：『伪侯周崔芝，乃郑逆腹心；其子周家政弃逆效顺，赍送伪印、关防，同其兄弟及伪镇将领兵丁家口、百姓男妇齐进温州黄华关，随就近安插』。下部知之。
庚申（二十五日），授福建投诚伪同安伯郑鸣骏为遵义侯、伪永成伯郑缵绪为慕恩伯。
九月辛未（初七日），靖南王耿继茂奏：伪庆都伯王秀奇投诚。
福建总督李率泰奏：『伪忠靖伯陈辉率文武伪官一百三十三员、兵一千六百名、家口八百余名投诚』。得旨嘉奖，下部议叙。
