脏腑说
喉在咽前，其系坚空，连接肺本，为气息之路。呼吸出入，由肺橐龠。肺居胸上，覆诸脏腑，故称华盖。虚如蜂窠，下无透窍，吸气则满，呼气则虚。肺气上通鼻窍，故谓肺开窍于鼻也。肺下为心，心有系络，上系于肺。心中有窍，与肺不同。心气上通于舌，故谓心开窍于舌。（按舌之腠理，即窍也。《原病式》注云∶古知味，不可云无窍，但细微，不似耳目等窍之大耳。故守真曰∶玄腑者，玄微腑也。脏腑皮毛骨肉筋膜，无处不有，乃气出入升降之门路。以此推之，则心窍在舌，可默会矣。若泥耳目等窍求之，固矣。）心外有心包络，即膻中也。形如仰盂，以包裹此心，使邪不能犯。犯者，包络当之。若犯至心即死矣。脾、胃、肝、胆、肾、膀胱各有一系，系于包络之旁，以通于心。此三者，皆在膈上。膈者，隔也。有膜与脊胁周回相着，遮蔽膈下浊气，使不得上熏心肺。膈膜之下为肝，肝气上通于目，故谓肝开窍于目。肝叶中有胆，胆中有汁，藏而不泻。以上肺、心、心包络、肝、胆，皆从喉之一路而下者也。咽在喉后，咽系柔空，下接胃本，为饮食之路，水谷由此入胃，与喉之气道不相犯。盖喉窍有一会厌覆之，如皮如膜发声则开，咽食则闭。故水谷下咽，了不犯喉。若当食而发声，则会厌忽开，食错入喉，喉不容物，遂呛而出矣。胃在膈膜之下，其上之左有脾，形如刀镰，能动而磨食使消化。脾气上通于口，故谓脾开窍于口也。胃之下口连小肠，小肠后附脊膂，前附脐之上，左环周回叠积，共盘十六曲。小肠之下口，右接大肠，（亦名回肠。）当脐左回周叠积，亦盘十六曲。其下为广肠，附脊左环叠积。其下名直肠，出肛门，为粪道。（广肠，即大肠下节之更大者。直肠，又广肠之末节耳。）广肠之左侧为膀胱，膀胱上无窍，只有下口出尿。饮食入胃，得脾消运，其精华之气，上升于肺。肺布之周身，以充血液，其余下入小肠。小肠受三焦之气化，泌别清浊，糟粕趋大肠以出，水饮渗入膀胱，（小肠与膀胱，虽皆无窍相通，而得气运化，腠理可以渗灌。）为尿以出。此全赖三焦气化施行，若气不施化，则闭塞不通而病矣。以上脾、胃、小肠、大肠、膀胱，皆从咽之一路而下者也。肾有两，形如豆，左右相对，而附于脊，各有二系，上系系于心，下系系于脊。肾气上通于耳，故谓肾开窍于耳也。心、肺、脾、肝、肾为五脏。脏者，藏也，所藏惟精气，藏而不泻者也。胆、胃、大小肠、膀胱为腑，腑如库之贮物。胆所贮者汁，亦藏而不泻。余所贮者水谷，则泻而不藏。虽有泻、不泻之殊，而均有所贮，则均谓之腑。但胆所贮者乃精汁，与水谷之滓秽不同，故胆独名为清净之腑也。心属火，肾属水，肝属木，肺属金，脾属土。而小肠与心经脉相连，故从心属火；膀胱与肾经脉相连，故从肾属水；胆与肝经脉相连，故从肝属木；大肠与肺经脉相连，故从肺属金；胃与脾经脉相连，故从脾属土。而脏属阴，则配乙、丁、己、癸、辛之阴干。故肝称乙木，心称丁火，脾称己土，肾称癸水，肺称辛金。腑为阳，则配甲、丙、戊、庚、壬之阳干。故胆称甲木，小肠称丙火，胃称戊土，大肠称庚金，膀胱称壬水也。
五脏五腑，两其五行而为十干止矣。而益以心包络与三焦为十二，何也？此千古所未明，而不可不言者，说见后篇。
心包络三焦说
心包络，《难经》谓其无形。然考《内经》论十二官，无心包络之名，而有膻中之号。盖膻中乃心之窝，心藏窝中，若包裹然，则膻中固即心包络，非无形也。三焦，《经》谓上焦如雾，（上焦，膈以上也。清阳之分，其气如雾。）中焦如沤，（中焦，膈下脐上也。水谷之区，停留如沤。）下焦如渎，（下焦，脐以下也。便溺所出，如决渎。）亦未言其形状。论者纷纷，皆如捕风捉影，毫无实指。惟张景岳谓即腔子，脏腑如物，腔子如囊之括物，人但知物之为物，而不知囊之亦为一物。其说甚通。（古谓三焦，有名无形者，盖指腔子内、脏腑外之空际言，乃三焦火气游行之处也。）予因是而思，人之脏腑只有十，而以心为君，余为臣。三焦即腔子，（窃谓“焦”当作“椎”，人身脊骨二十一椎，上焦乃上七椎，中焦乃中七椎，下焦乃下七椎也。“椎”别作“焦”耳。观《灵枢·背 篇》五、七、九、十一、十四各椎俱作焦可见。）如京城，君臣所同居也。
心包络即膻中，如宫城，君所独居也。宫城在内，京城在外，内为阴，外为阳，故三焦亦称腑，而心包络亦称脏耳。三焦既即腔子，则为有形，有形则有经脉。凡腔子中之经脉，皆三焦之经脉，但不分地立名，难于指称。故将其与各脏腑络系者，分属所络系之脏腑，名曰某脏某腑经脉。而以其无所击属者，名三焦经脉。
犹之九州之地皆王土，而除分封诸侯外，余为王畿。心包经脉，亦三焦经脉之络系于膻中者所分属，为十二经也。（奇经八脉，亦即三焦经脉另立名目分出，如王畿内有公卿大夫采地也。）
五脏配五行八卦说
心肺位居膈上，而肺尤高，天之分也，故属干金。肝肾位下，而肾尤下，为黄泉之分，故属坎水。坎外阴而内阳，阳气潜藏于黄泉之中。静极复动，故冬至而一阳生，惊蛰而雷出于地。肾水得命门之火所蒸，化气以上，肝受之而升腾，故肝于时为春，于象为木，于卦为震雷、巽风。（肝之怒而气盛如之。）阳气上升，至心而盛，阳盛则为火，故心属火。于卦为离。离，南方之卦也。圣人向明而治，心居肺下，乾卦之九五也。实为君主，神明出焉。离、干中画之变也。兑、干上画之变也。肺居心上，干之上画也。上画变而为兑，于时为秋，于象为金，金性沉降，秋气敛肃，阳气升极而降，由肺而降，故肺又属兑金。（心火上炎，肾水下润，坎离之定位也。火在上而下降，水在下而上升，坎离之交媾也。肾水上升，由肝木之汲引，地道左旋而上于天也。心火下降，由肺金之敛抑，天道右旋而入于地也。）脾脏居中，为上下升降之枢纽。饮食入胃，脾为行运其气于上下内外，犹土之布化于四时，故属土。于卦为坤、为艮。金、木、土皆配两卦，而水、火各主一卦，故五行惟水火之用为独专也。
水火说
男女媾精以成胎，精即水也，精中之气即火也。水火精气，妙合而凝，是为胎元。精以成形，气以成神，以其原于父母，故曰先天。然五官百骸，皆本此精以为质，而无非此水所灌充也。呼吸运动，皆本此气以为机，而无非此火所流行也。其独指肾为先天者，则以精气先结胞胎，中起一茎，形如莲蕊。一茎，即脐带也。莲蕊，即两肾也。两肾为水，命门之火寓焉。一阳藏于二阴之中，于卦为坎，以脏腑之始结在此，故独以肾中水火为先天也。先天水足，则儿肥盛而润泽；火足，则儿强健而精明。水得火，则气常温而不至于寒，火得水，则形常润而不至于槁。
苟先天水火一有偏胜，则禀受失其中和，而后天培养之功，为不可少矣。人生一日不再食则饥，故有资于饮食，则脾胃司之。胃主进纳，脾主运化，饮食之气味精华，由脾胃以灌输周身。气日盛而体日充，先天之水火赖此滋养以生生不息，故以脾胃为后天之本也。总之，人身中润泽之气即水也，温暖之气即火也。一有偏胜，其致自饮食者，调之甚易，其禀于胎气者，治之甚难，故先天为重。然不以畏难而废治，全赖饮食以救弊补偏，故后天为要也。
火根于肾，而属诸心，何也？曰∶肾于卦为坎，于令为冬，于位为北，本水之宅也。而阳根于阴，则火生焉，下潜而上升。心于卦为离，于令为夏，于位为南，则火之宅也。至其宅而后旺，故从其旺而属之心也。其曰∶心为君火，肾为相火。
又曰∶君火以明，相火以位，何也？曰∶君者主也，向明以治。心为一身之主，神明出焉，故称君。相者竭其才能以奉君出治者也。肾位于下，输其火于心，以为神明之用，犹相臣竭其才力以奉君出治，故称相。位以职掌言，明以功能言也。火者，人身温和之气也。五脏六腑，皆有此温和之气，各归其部，则各有其位，各效其能，则各有其明。肾中相火，非无明也，阳方潜藏，光未被乎四表，职司封蛰，龙不离于深渊，故不言明而言位。失其位，则有飞扬僭越之患矣。心中君火，非无位也，君主无为，不与臣下较职守，神明有觉，独从方寸着虚灵，故不言位而言明也。失其明，则有昏惑晦昧之忧矣。然则君火、相火，皆吾身阳和之正气，而不可无者。而或指之为邪，谓君火可直折，相火不可直折，何也？曰∶失其正则为邪，失其和则为热。故谓君、相火为邪火者，乃指君火、相火之邪热者言，非君火、相火之本为邪也。直折犹云正治，治热以寒，治之正也。君火属心，居于上焦，其病无与于下。无与于下，则根本之真阳无恙，特炎于上者过乎赫曦，故可以寒凉治其有余之邪，使归于正，无所损于本原也。若肾中相火，居于下焦，病则必干乎上，无论下焦为寒鸟热，热固上僭，寒亦上浮。盖肾中水火同根，本无偏胜，若热盛而水亏，则火必致上炎；寒盛而火虚，亦必火因寒逼，不安其宅而上浮也。故言相火为病者，乃因其在上之热，而直探其在下之根言之。病既根于下，则不可以治上者治之矣，何也？火虚而治以寒凉，是益助其下焦之寒，火愈被逼而上浮矣。且为寒所逼之火，本无根之残焰，而又以寒折之，有不消灭者乎？水虚而火炎，若无妨于寒凉，不知火炎本乎水虚，不用平润之剂以补水，而徒用苦寒以制火，是何异因金银之缺少，而凿平马以相就，必致并伤其火而后已，故曰不可直折也。相火静而藏则属肾，动而发则属肝胆，此火布 于三焦，而心包络为三焦之脏，若肝之配胆，故又曰∶肝胆、三焦、心包络相火也。
命门说
《难经》谓∶肾有两枚，非皆肾也，左为肾，属水，右为命门，属火。后人非之，谓两肾皆属水，命门在两肾之中，当脊骨自上数下第十四椎陷中；若自下数上，则为第七椎，正与脐对。引《内经》∶鬲肓之上，中有父母，（谓心也。）七节（即第七椎）之旁，中有小心为证。谓两肾在七节之旁，两肾中间，即七节之陷中也，小心即命门。
《医贯》又以中字为解，以太极形容。谓一中分太极，中篆作，○，太极也；│ 分太极为○。者。│，象人之脊骨，○，象人之两肾，两肾○相合，仍为一太极○。其中空白处，象命门。又两肾既分为两仪，则左肾为阴水，右肾为阳水。阳水者，气之液也，坎水也。坎以一阳陷于二阴，水气潜行地中，为万物受命根本。《月令》于仲秋云∶杀气如盛，阳气衰，水始涸。是水之涸，地之死也。于仲冬云∶水泉动。是月一阳生，是水之动，地之生也。阴水者，形也。
兑，泽也。一阴上彻于二阳之上，兑以有形之水，普施万物，下降为资生之利泽，其说甚有理。然与《难经》所言，大致亦自无殊。盖皆言肾虽属水，而水中有火耳。
所用补火之药，总属一样，岂有分别此味则入右肾，彼味则入七节？忧其岐误，致烦辨正哉。至赵氏谓命火乃先天之元阳，肾水乃先天之元阴，为生命之根本，治病必须求本。故凡寒之不寒，（用寒药以治热，而热不退。）是无水也。无水者，壮水之主（主水者肾。）以制阳光，当主六味丸。热之不热，是无火也。无火者，益火之原以消阴翳，当主八味丸。（并见虚损。）遵其说而用之败证。效诚如神。若初起遽以此投之，则谬矣。何则？初病止伤其后天之血气，未遽累及先天之水火，故但热之则寒消，寒之则热退，随手立应，何必他求。乃不去其邪，而遽补其正，有不迁延时日，坐失事机者哉？何今之为医者，泥于《医贯》之说，不论新病久病，非六味则八味，非补中（见气）。则归脾，（见血。）竟若历古方书，皆可删却，亦惑之甚矣。或问∶气即火也，血即水也，儿在胎中，气血已具，是气血亦先天所生；六味补水，八味补火，是水火亦后天所养。今谓气血为后天，水火为先天，毋乃轻气血而重水火乎？曰∶气血者，水火之大纲也。人身呼吸运动，知觉神明，皆此火之为之也。气可以言呼吸运动，不可以言知觉神明，是气虽即火，而不足以尽火。人身之血液精髓，皆此水之为之也。血特水中之赤者耳，不可以概其余，故血虽即水，而不足以尽水。有生之初，胎孕始结，形如露珠，父母之精气也。是水火乃先天之先天，数月形成，而后血气具，是血气为先天之后天。若夫既生之后，饮食所长养之气血，其为后天，又不待言矣。此水火、气血，先后天之分如此。先天实为后天之根，故水火为气血之原，而下焦又为中上之根，故肾命为水火之本。其轻重之分，固不能以无别也。
（先天水火，又互相为根，如嘘气成水，阴根于阳也；蒸水成气，阳根于阴也。）
五脏生克说
五脏生克，须实从气机病情讲明，若徒作五行套语，茫然不知的，实多致错误。
