却说元始天尊向众弟子询问为何清虚未至，但在看到众人一脸茫然时，熟悉清虚为人的元始天尊便知道清虚出事了。
心头一动，发现有圣人暗中搅乱天机。元始天尊一声怒哼，取出盘古幡向空中划出一道，瞬间理清了混乱的天机。明白了前因后果的元始天尊起身便要向外走，却眉头一皱停了下来。
众弟子见元始天尊行为均不明所以，但也不敢相问。这时却听元始天尊开口道：“子牙，你清虚师兄今日未来想你道贺是因为受伤了，并非是其他缘故。”
姜子牙听到元始天尊之言忙开口道：“清虚师兄数次相助弟子，弟子对清虚师兄感激不尽，怎会怪罪师兄。”
这时三代弟子之中，杨晓莲、黄天化出列上前跪倒在元始天尊面前急切道：“敢问师祖，我师父他怎么会受伤呢。”
看着面前跪倒的徒孙，元始天尊温和的道：“你二人不必担心，你老师无甚大碍，只需闭关调息数月便可痊愈。”
听到元始天尊的话，杨晓莲、黄天化两人放下心来，但想着稍后回青峰山中看望清虚。
就在元始天尊理清天机之时，碧游宫中的通天教主就知道自己五名弟子截杀清虚一事算是失败了，“二师兄有个好徒弟啊。”通天教主赞叹一声，心头一动远在万里之外的诛仙阵图裹起诛仙四剑与多宝道人五人化作一道流光消失不见。
此时被困于五行剑阵中的清虚知道危急已经解除，想必定是自己老师欲要出手才迫使通天教主召回一众弟子。擦了擦再次从嘴角流出的血迹，清虚不由得露出一丝苦笑，看来伤势不轻还要闭关恢复等一年半载的。原本自己还打算在万仙阵中稍稍改变一下日后截教衰败，佛教大兴的局面，可是等自己恢复伤势以后，恐怕姜子牙都攻破五关了。
这时白鹤童子驾云而至对清虚说道：“师兄，老师已知师兄之事，特命我来转告师兄不用去西岐了，回山静养去吧。”
听到白鹤童子之言，清虚对白鹤童子道：“还请师弟回去告诉老师，伤势好转后在上昆仑山拜见老师。”
说完清虚便与白鹤童子道别离去，回青峰山紫阳洞中闭关疗伤去了。
再说姜子牙金台拜将之后，便到王宫中请武王姬发御驾亲征，武王应允。姜子牙便命众将日夜操练人马，待操演停当后点齐人马六十万择吉日东征。
六十万大军兵出岐山，过关斩将。至界牌关时正遇诛仙剑阵，因为最得意的弟子受伤的元始天尊请来太上老君、接引道人、准提道人破了通天教主的诛仙剑阵。使得姜子牙大军攻破界牌关继续前进。
碧游宫中通天教主在诛仙剑阵中被四圣围攻后便知恐怕自己截教将有大难，在多宝道人被擒后通天教主便想为截教留下些香火。思索一番通天教主唤来无当圣母、金灵圣母、龟灵圣母、云霄四人对其说道：“数月后为师会率万仙在潼关布下万仙阵与阐教决一死战，到时你四人便留在碧游宫中，不许擅自出宫。”
无当圣母等人一听大惊，纷纷出言欲与通天教主一起去与阐教众人决战。通天教主听到几位亲传弟子之言长叹一声，说道：“为师在诛仙阵之败后，推测天机算出我截教有灭教之祸，便不让你等前去，也是让你们为我教留下些根本，以图他日再兴。”
无当圣母、金灵圣母、云霄三人听通天教主之言脸色俱都一变后便低头不语，而龟灵圣母却在通天教主面前跪倒道：“老师，弟子本是一玄龟，后蒙老师不弃拜在老师门下。弟子也知自己资质不如两位师姐，心性也不如云霄师妹。今日我教有难，如老师门下无一亲传弟子上榜恐教中其他同门心中必有想法，所以龟灵愿与老师同去潼关会拿阐教一会。”
“好吧。”听龟灵圣母之言，通天教主只得答应下来。
可是龟灵圣母未曾想到的是，自己在万仙阵中虽然有难但却未身死，而是被西方接引道人收进袋中并打算破了万仙阵后将其带回西方。而封神榜原著中吸食龟灵圣母的蚊妖并未吸食到龟灵圣母但却仍然飞到西方将接引道人的十二品金莲吞食了三品。
万仙阵一战，通天教主正如原著中一样，被四圣联手杀的大败，而那万仙除了上榜的上榜，还有三千红尘客被接引道人渡去西方。从此截教一蹶不振，而西方也渐渐有了大兴之势。
随后姜子牙大军一路高歌，破潼关，过渑池。虽然在渑池县时折了黄飞虎、崇黑虎、闻聘、崔英、蒋雄、土行孙众将，但最后还是攻破渑池。而后渡过黄河，八百诸侯相会孟津共同推举武王为盟主，皆言听从武王之命讨商伐纣。
这时青峰山紫阳洞外，自从万仙阵后，觉得姜子牙大军再无何凶险的杨晓莲、黄天化、邓婵玉三人便回到青峰山上一直在紫阳洞外等候清虚出关。
就在武王会盟诸侯的前三日，清虚终于将体内那一丝诛仙剑气全部除去，使得自身伤势痊愈。“这三个痴儿。”已无大碍的清虚起身出了紫阳洞看着盘膝坐在洞外的杨晓莲三人清虚心中一股暖流流过。想自己回到洪荒这千万年来不再是孤家寡人一个，有老师，有诸位师兄弟，还有孝顺的弟子。清虚嘴角不禁露出一丝笑容。
轻咳一声，闭目的杨晓莲三人睁开眼睛，看到老师已出关来正在洞口望着自己。“老师在上，请受弟子一拜。”杨晓莲、黄天化、邓婵玉三人眼圈微红跪在清虚面前重重叩首。
“痴儿，莫要作此小儿女之态。”清虚笑着将三人扶起，并将三个弟子带入紫阳洞中叙话。
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