玉麒麟将神农送回烈山部落后自己回转青峰山。
神农的回归使烈山部落的首领少典很是高兴。少典年纪大了，领导烈山部落早已力不从心。神农回来后，立刻被少典带在身边学习处理部落事务。
神农也应用从清虚道德真君处所学的知识提出了不少合理的建议，使烈山部落的得到了快速发展。
四年后，神农年龄已到二十，行了加冠礼。此时少典已年老体衰，便正式把烈山部落首领的位置让给了神农。部落的人民都心悦诚服。
神农成为烈山部落的首领后，应用大力改革部落的构成和运作方式，将部落分为三部分，每五年神农带领其中一部向外寻找适宜生存的地方迁徙，使得烈山部落控制的地域不断扩大。部落的三个部分交替进行，既能有时间消化所获得的成果，也能加快部落壮大的速度，大大提升了烈山部落在人族的影响力，逐渐成为仅次于伏羲所在的华胥部落的人族第二大部落。
在不断向外开拓领地的过程中，神农也不断寻找各种能够帮助人类生存的植物，其中发现五种植物适合大规模种植，分别是麻、黍、稷、麦、菽。这五种植物被成为“五谷”，逐渐成为人类在洪荒大地生活的主粮，促使人类的生产方式逐渐由以狩猎为主的生产方式向以农耕为主的生产方式转变。使人类的生产生活得到了极大的发展。
另外，神农还用赭鞭鞭打各种所遇到的植物，尽知其平、毒、寒、温之性，还亲口尝试各种植物和一些动物、矿物，观察人体对各种植物的反应，最多的时候曾一日之间而遇七十毒，好在有清虚道德真君所赐的仙茶，这些毒都能被仙茶所解。神农从中筛选出了比较常见而且药效突出的三百六十五种药物，将其分为上、中、下三品，编成《神农本草经》，广泛流传于人族，使得人族有了自己的第一部药典。
这两件大功德之举，使得神农在人族之中声名日隆。天皇伏羲对于神农也极其重视，也常派人咨询神农对一些人族发展大事上的见解。
天皇八十一年，伏羲功德圆满，人教圣人太上老君派玄都大法师降临陈都，封伏羲为人族天皇，天地有感，伏羲有大功德临身，觉悟前世今生，得了亚圣果位，被入住火云洞，这个原是红云祖师生前所住的洪荒大地顶级洞天之一。
伏羲证道时，昭告天下，将人皇之位禅让于神农。从此人族进入地皇时代，神农此时正年富力强，兢兢业业为人族的发展努力工作。
将打理烈山部落的经验推广到全体人族之中，使得人族人口、地盘均极大的得到了发展，也使得洪荒万族不少血脉也逐渐融入人族之中，使得人族的发展潜力越来越大。
不过在这个进程之中，神农也发现了一些问题，其中巫族血脉流入人族之中，因为巫族血脉也颇为强势，使得这些巫人比普通人族更加强壮，这些巫人集中在洪荒大陆南疆地区，明面上还是听从神农的号令，但是实际神农的命令并不怎么能得到有力的贯彻执行。
