二十四年（一八四四）三月，刘韵珂等奏：台湾嘉义县巨匪洪协等纠众竖旗谋逆，并有已革武生郭崇高合伙起事，所纠匪党约共二千余人。经该镇、道等督同各员弁带兵剿捕，接战六次，杀毙贼匪一千余名，将首逆洪协及股首杯孕等先后拏获。又嘉义县匪徒李安等纠匪滋事，经营、县往拏，擒获多名。奉谕：办理尚属妥速，所有已获各犯，着饬该镇道取讯确供，即在台湾地方分别正法；其在逃之股首郭崇高、刘取、叶周、余朝，仍着上紧严拏，务获惩办，毋任漏网。
二十五年（一八四五）三月，调吴其浚为福建巡抚。
八月，调郑祖琛为福建巡抚（以上东华录）。
二十七年（一八四七））九月谕：福建台湾道熊一本着撤回内地酌补，所遗员缺着徐宗干补授（斯未信斋文编）。
十月刘韵珂奏：履勘台湾水沙连六社番地，体察各社番情，据实覆奏。奉谕：该生番输诚献地，固由不谙耕种，谋食维艰，欲求内附。惟利之所在，日久弊生，生番合坏而居，不能不与汉民交易。日后官吏控驭，偶或失宜，即易激生事端。国家开辟边境，计划必周；与其轻议更张而贻患于后，不若遵例封禁而遏利于先。所议自系筹及久远，未肯迁就目前。且此项番地，旧以土牛为界，乾隆年间复立石碑，例禁綦严；自应恪遵旧章，永昭法守。该督所请六社番地归官开垦之处，着毋庸议（东华录）。
九月初十日，淡水飓风大作，大雨滂沱；至十四日稍息。大加蚋、芝兰、三貂、石定等四保，同时被水，倒壤民房，淹毙人口甚多；盖藏米粟悉被漂流，桥道塘汛亦多冲塌（斯未信斋文编）。
十一月初八日辰刻，台湾郡城地震，由南而北，较往年为重（同上）。
——录自福建通纪卷十六。
文宗咸丰元年（一八五一）三月，闽浙总督裕泰奏：漳、泉会匪已获要犯多名，现在提省审办，并密派委员赴台查禁私矿（东华录）。
澎湖厅初四日至初六日风霾大作，刮起海水，遍地飞洒，土人称为咸雨；瘠土皆成斥卤。最重之处，所种杂粮苗叶枯萎，收成无望（斯未信斋文编）。
四月，修福建台湾厂战船，从总督裕泰请也（东华录）。
五月，以王懿德为福建巡抚（王靖毅年谱），以季芝昌为闽浙总督（东华录）。
吕恒安、徐宗干奏：澎湖厅上年晚收歉薄，本年三月复猝被风霾，以致杂粮枯萎，民情倍形拮据；业经会商于道库提银二千两，又拨银三千两，委员解往该厅，查明分别抚恤。
振福建澎湖厅被风灾民。
八月，以办理福建噶玛兰开垦出力，予通判朱材哲等升赏有差。
九月，闽浙总督兼署福建巡抚季芝昌因病赏假；以调任福州将军裕瑞兼署闽浙总督、布政使庆瑞暂护福建巡抚。
十月，缓征福建台湾澎湖被风霾咸雨灾民地种、船网沪缯银（以上东华录）。
台匪洪纪等纠党树旗谋反，以红布条各挂襟纽为号；先在嘉义县属官伷、六甲等庄派饭索银，沿途抢掠。经台湾镇、道叶绍春、徐宗干督饬文武员弁并力攻剿，毙匪无算；先后生擒四大股首伪大元帅洪纪、总大哥林闹、伪副元帅林仰、李兆基、伪军师胡枝囗〈牛母〉、伪先锋林罩、颜耀、分股首陈潮及伪旗首旗脚一百余名，正法枭示。其胁犯及闻拿投首者，分别遣发、徒杖有差（斯未信斋文编）。
二年（一八五二）五月，以王懿德兼署闽浙总督（王靖毅年谱）。
六月，命升任福州将军桂良来京，以闽浙总督季芝昌兼署福州将军（东华录）。
台湾道徐宗干奏：台匪罗阿沙等戕官倡乱，现饬中营游击夏汝贤、水师营弁李朝祥统带水陆营兵勇，会合屯丁义首，由南路进剿，毙匪无算，生擒匪犯一百七十余名。凤山县城，业经克复。又会同镇营北路攻剿，焚毁罗阿沙伪帅府，搜出伪印、袍甲、旗械、枪炮，先后生擒伪大元帅罗阿沙、赖棕伪副元帅、伪将军、伪军师、伪先锋及大股首，并戕官正犯伙匪四百余名，分别审办，凌迟斩枭。地方现渐肃清（斯未信斋文编）。
九月，台湾道徐宗干奏：续获戕官首犯林恭等二百余名，并搜出凤山县典史、巡检印颗。内有总伪先锋吴阿班，讯系内营水师革兵，曾入小刀会；供认勾结厦匪，密约洋匪首纪猫生纠党，于秋间赴台接应。随飞移安平澎湖协副将、艋舺营参将协同各厅、县兵勇加意防捕；旋捕获洋匪纪猫生等三十余犯，均供认前情不讳，分别审办。水陆各营现仍严密巡防，需饷接济。归庄难民，正在集捐筹恤（斯未信斋奏疏）。
徐宗干奏：行抵凤山，审明续获大股首林芳等二十六名，就地正法。又周历被匪焚毁之阿猴、万丹、阿里港各庄，据各乡民控诉，粤众剿贼，不无波及滋扰；已将粤庄丁勇撤退。又绕道至山猪门等处闽、粤杂处各庄，妥为安抚。又附奏噶玛兰通判董正官会营剿贼遇害（斯未信斋奏稿）。
十月，吴文镕调补闽浙总督（吴文节公遗集年谱）。
三年（一八五三）正月谕：朕现闻闽省洋面广艇匪徒愈肆滋扰，台湾米船间被抢掠，以致台米不能渡海，闽、浙粮价增昂。福建水师提督郑高祥不能乘坐海船，每遇巡洋，往往藏匿海囗〈氵义〉，逾时捏报欺饰。似此怯懦无能，无怪匪徒日肆。且江、浙二省现办海运，设使洋面稍有疏虞，所关非细。着怡良、王懿德迅即确查，郑高祥如有前项情节，不胜水师之任，即行据实参奏（东华录）。
三月，以福建巡抚王懿德兼署闽浙总督。
四月，台匪戕台湾令高鸿飞、嘉义令王廷干。
五月，台湾副将吕大升护送琉球贡使自京旋，饬募泉勇五百名渡台助剿（以上王靖毅年谱）。
六月，以福州将军有凤兼署闽浙总督（东华录）。
台湾副将曾天明、都司凌敬会同副将吕大升击贼于嘉义，大败之；收复县城，获伪中路元帅曾鸡角、伪军师吴海、伪先锋石乞食、股首汪大忒正法（王靖毅年谱）。
七月，御史蔡征藩奏：风闻台湾府城被围，请简员解散。略云：此次匪徒滋事，台湾镇并不亲行，仅委县令会同守备孟浪前驱，以致被贼戕害，现在直扑府城；凤山县属亦被贼围。奉谕：前据王懿德奏，台湾道徐宗干与该镇恒裕意见不合，当将该员等交部议处，仍责令该镇、道迅将滋事各犯拏获。现着该署督即饬令澎湖协副将邵连科前往台湾，会同恒裕等相机妥办（东华录） 御史陈庆镛奏：台湾土匪于五月十二日攻台湾府城，经商人等登城拒守，并合民勇杀贼五、六百名；知府裕铎自出家财助饷，其在台之商郊各帮与现赴天津之台商各船均各踊跃捐饷，以备军需。现在凤山县有游击曾玉明守住火药局，被贼围困，救兵莫达。贼目有林许为渠魁，吴王二姓为主谋云云。奉谕：前有旨令有凤驰往福州署理总督篆务，此时如已拒闽，即着王懿德与有凤按照该御史所奏查明筹办。该御史又称台湾在籍前任礼部员外郎郑用锡、候补主事施琼芳、候补道林国华、道职林占梅均堪办理围练劝捐事宜，着该署督等谕令该绅士等或捐赀助饷、或出力督团；但使地方肃清，必当优加奖励（东华录）。
八月，调闽浙总督吴文镕为湖广总督，以署四川总督慧成为闽浙总督；未到任前，仍以福州将军有凤署理（东华录）。
十月，台湾镇、道恒裕、徐宗干会奏：粤艇盗匪迭在内地各洋劫掳，经淡水厅同知张启煊、安平协副将吴朝良督饬员弁绅商义民分路搜捕，先后击沈贼船，擒拏斩枭首、从九十二犯，起获铜铁大炮六十五门，搭救商渔难民无算（斯未信斋奏折）。
四年（一八五四）正月，以王懿德为闽浙总督、吕佺孙为福建巡抚（东华录）。
二月，蠲免上年被扰之云霄、石码、厦防、永春、龙溪、漳浦、海澄、长泰、同安、安溪、仙游、沙、永安、尤溪、德化、大田、凤山十七厅州县额赋缓征兴粮，淡水、台防、噶玛兰、平潭、蚶江、马港、龙岩、莆田、平和、诏安、南平、台湾、嘉义、福清、永福、闽清、古田、晋江、南安、惠安、南靖、顺昌、将乐、漳平、宁洋、彰化二十七厅州县及水口、南日、峡阳、罗溪、全门、佛昙桥、华崶七县丞所属新旧额赋有差（东华录）。
以王懿德兼福建巡抚（同上）。
三月，副将曾玉明获台湾噶玛兰匪首吴磋于中心仑，诛之（王靖毅年谱）。
十二月，总督王懿德上「按户抽丁，窒碍难行」疏，略言：闽省负山面海，并控海外台、澎。上游山深菁密，村落零星；下游聚族而居，民贫俗悍。大姓欺小姓、强族欺弱族，动辄械斗，已成锢习。若令抽丁当兵，不但无益地方，械斗恐将滋甚。台澎、闽粤杂处，久分畛域；非戍以客兵，万难镇压。且巡洋守卡，往返千里，尤非籍兵所能从事。丁粮归并以来，民无徭役；兹拟抽丁办法，歆以免役空言，不但民皆沮疑，并恐粮多抗欠。且裁兵则营弁随同裁减，所抽之兵漫无统辖；若归州县则牧令尽掌兵权，若设营官则守备兼管民事，查与定制两妨。至抽丁散处城乡，稽查匪易；恃强凌弱，遇事逃亡，老弱充数，缺额虚名；偶有征调，吏胥一出，此户骚扰。此又利未见而害先形者也。请仍遵旧制，以免纷更（王靖毅年谱）。
是年，台湾道兼学政徐宗干奏请台属捐数较多，请增广中额学额（斯未信斋文编）。
又奏：以军饷久绌，请集捐收铜并准以铜折银报捐，设炉铸造当一大钱；并由台地船厂购运废铁，兼铸当一铁钱参用（斯未信斋奏折）。
五年（一八五五）三月，逸贼黄位勾澄海外砂乡巨匪黄兴顺扰厦门、淡水厅鸡笼头暨广东澄海、九龙炮台等处；劫掠渔商。署南澳镇总兵陈应选、绅士洪凤翔、谢友德、顾绍荣、詹廷光雇商船伏兵诱之于莱芜洋，击沈匪艇三十余只、获其九，生擒贼伙王阿鳌等三十六名；兴顺逸放鸡洋（王靖毅年谱）。
追予福建阵亡知县高鸿飞入祀京师昭忠祠，并于台湾任所建立专祠。
十二月，予故台湾镇总兵官吕大升祭葬恤荫如军营病故例（以上东华录）。
七年（一八五七）正月，以庆瑞为福建巡抚。
八年（一八五八）九月，以瑞璸为福建巡抚。
十一月，瑞璸因病乞假，以庆端兼署福建巡抚（以上东华录）。
——录自福建通纪卷十七。
穆宗同治元年（一八六二）正月，以徐宗干为福建巡抚；未到任前，以学政厉恩官暂理。
四月，彰化县境戴万生等聚众滋事，台湾道孔昭慈督兵捕之；兵内变，彰化县城失守，副将夏汝贤等殉难，孔昭慈不知下落。总督庆端派总兵曾玉明等往剿，奏留升任汉黄德道、洪毓琛在台会辨；以台民攀留故也。提督石栋请调回赴浙师船，由鹿港登岸堵截。
五月，以洪毓琛补台湾道，查明昭慈等阵亡，诏予祭葬、世职。
六月，曾玉明由浙防赴泉州统兵渡台。戴万生等分股围扑嘉义县城及斗六等处，文武员弁潘恭赞、义民潘谛等均力战捐驱，遂解嘉义围，并攻复大甲土城。玉明督同官兵义勇进攻彰化，又败贼于大脚佃庄，并将潮洋厝等处匪巢攻毁。耆龄调金、厦、兴化等营助剿。
七月，彰化匪徒分犯嘉义、鹿港等处，虽经官军击退，戴万生踞守县城，匪众尚多。曾玉明等已由鹿港登岸，并有军功施九挺等募勇协剿。参将林文明愿赴台助剿；有旨：着调台勇一千名，交其统带迅速前往（以上东华录）。
九月，官军正在围逼彰化，另股匪党窜陷斗六，复扑嘉义。总督耆龄奏派关镇国等管带师船，并添派陆兵三百名渡台。署金门守备黄炳南管带师船，中途折回；奉旨：先行革职，交耆龄、徐宗干严行审讯（东华续录）。
十二月，吴鸿源署水师提督，统带各军援剿嘉义。玉明一军在鹿港专顾北路，而笨港绅民协力，复解嘉义围。
二年（一八六三）二月，台匪久踞彰化，台湾道洪毓琛等派义首李成龙等由盐水港进剿北路。其另股分扑嘉义之贼，亦经参将汤得升等先后击退，保全嘉城。彰城踞匪无多，吴鸿源已统领全军抵台（以上东华录）。
三月，闽浙总督着左宗棠补授，仍兼署浙江巡抚。
四月，令耆龄即将所办闽浙两省防剿事宜及所部各军移交左宗棠接办。
耆龄奏：台湾官军剿匪，添派曾元福驰往夹剿（以上左恪靖伯奏稿）。
五月，曾元福由泉州行抵鹿港。吴鸿源一军自嘉义解围后，扫荡附近贼庄，迭有斩获。斗六贼多败遁，官军迫至彰辖西螺、二重沟等处；玉明由鹿港逼近彰城。戴万生已窜回四张犁本庄，余匪仍扼踞死守（东华续录）。
七月，曾元福进扎白沙坑，设计攻破大岸头各庄竹围，并将大埔、八卦山等处贼巢尽行焚毁。吴鸿源冒暑染疫，暂回嘉义。徐宗干檄元福由间道直趋嘉义，接署水师提督。台湾道毓琛病故，遗缺以知府陈懋烈暂署（东华续录）。
八月，台湾粤勇溃散，左宗棠奏请饬四川建昌镇总兵林文察办理台湾军务。奉旨：吴鸿源所统兵勇数已不少，不能于嘉义解围以后，迅图攻剿，辄于南靖庄等处顿兵数月，致该匪得豫为准备；迨贼守御既坚，又不知分兵别觅间道相机兜剿，以致师老财匮，勇丁哗溃，贼氛益肆猖獗，实属调度乖方。业经明降谕旨，将该员革职拿问；仍着左宗棠、徐宗干确切查明，据实参办，毋稍徇隐。林文察既籍隶台湾，熟悉情形，即着该署提督拣练得力将士渡台，联络绅团，速将该处匪徒殄灭；应需饷项，即饬福建藩司于援浙饷内酌量拨给。徐宗干奏吴鸿源尚知奋勉，暂缓拏问，留营效力自赎。林文察署理水师提督，丁曰健补台湾道（东华续录）。
以英桂为福州将军（东华录）。
