刘建藩占据零陵，和北军对峙了好几天，因为寡不敌众，败多胜少，不得不向广西、广东请求支援。段祺瑞也害怕两广插手，暗地里派人鼓动当地官吏反抗省政府，牵制他们的行动。正好广东惠州清乡总办张天骥被省政府免职了，由刘志陆继任，张天骥心怀怨恨，于是对省政府宣布独立。刘志陆带兵进攻，惠州帮办洪兆麟、统领罗兆昌、帮统刘达庆等，联合刘志陆，攻打张天骥。张独木难支，只好逃走。偏偏潮州镇守使莫肇宇此时也和省政府脱离了关系，说只服从中央的命令，后来又联结钦廉道冯向荣、镇守使隆世储，气势浩大。张天骥也投奔了潮州，并和莫一起电达中央，表明心意。段总理收到消息非常高兴，当即剥夺广东督军陈炳焜的职务，特任省长李耀汉兼任督军，并命莫肇宇一同督办。
民国创立以来，各省虽然都说军权和民政分开，实际上全都是军阀专权。自从黎政府成立以来，虽然治理军队交给督军，治理民政的叫省长，但是督军手里有兵权，所以差不多都是督军说的算。段总理将陈炳焜解职，要李耀汉兼职，就是一条反间计。很显然陈炳焜不肯交出兵权，李耀汉心里也清楚，所以和从前一样照常办事。随后陈炳焜联合广西支援湖南，和刘建藩并肩作战，所向披靡，夺回了宝庆、衡山，后来又攻占衡阳、湘潭。傅良佐每天提心吊胆，向段总理请求支援。段总理非常惊讶，但远水救不了近火，只好任命王汝贤为湘南总司令，范国璋为副司令，要他们扫平湖南叛军，可是两人只是逗留不进，反而通电中央和各省，商请双方停战。电文上大概说：
天祸中国，同室操戈，政府利用军人，各执己见，互走极端，不惜以百万生灵，为孤注一掷，挑南北之恶感，竞权利之私图，借口为民，何有于民？侈言为国，适以误国。果系爱国有心，为民造福，则牺牲个人主张，俯顺舆论，尚不背共和本旨。汝贤等一介军人，鲜识政治，天良尚在，煮豆同心。自零陵发生事变，力主和平解决，为息事宁人计，此次湘南自主，以护法为名，否认内阁，但现内阁虽非依法成立，实为事实上临时不得已之办法，即有不合，亦未始无磋商之余地。在西南举事诸公，既称爱国，何忍甘为戎首，涂炭生灵？自应双方停战。恳请大总统下令，征求南北各省意见，持平协议，组织立法机关，议决根本大法，以垂永久而免纷争，是所至盼！特此电闻。
电文发出去后，零陵军和两广各军还是不肯罢休，仍然大张旗鼓，进逼长沙。湖南督军傅良佐手下士兵寥寥无几，就等着王汝贤和范国璋出兵援助，偏偏他们宣告停战，还有倒戈的迹象，急得傅督军不知道怎么办才好，最后和代理省长周肇祥想出一条逃命的上策。他们乘着夜色，偷偷乘兵舰奔赴岳州。长沙失去主帅，省城各团体自发组织湖南军民建立两政办公处，正好王汝贤领兵回省，于是大家推举他为主任，维持秩序。
段总理收到消息后火冒三丈，急忙跑到总统府，痛骂王汝贤和范国璋叛逆。冯总统也不说话，段才发觉有隐情，猜想他们是老冯暗中指使的，于是说道：“总统主和，祺瑞主战，两人意见不统一才会这样。祺瑞请求辞职，请总统另换别人吧。”冯总统淡淡地说：“傅良佐身为督军，弃省潜逃，也不是没有责任。”段祺瑞说：“王、范两军无故倒戈，良佐孤立无援，自然逃走了。”冯总统又说：“我什么时候主和了？如果能戡定南方，就是让我亲自率兵前往我也愿意，请总理不要误会！”段祺瑞站起来说：“祺瑞不敢再当这个总理了，是战是和，请总统看着办吧。”说完就走了。没一会儿，他便递上了辞职信，又过了会儿，递上了国务员的辞职信。冯总统不好答应，派人挽留，并通电各省，言语隐晦，看不出来是主战还是主和。电报里看似在斥责王汝贤、范国璋，但是没有提出他们的名字，其实他只是为了顾全总理的面子，才写的这封模棱两可的信。
湖南第二师师长陈复初，部队刚刚改编为陆军第十七师，驻扎常德。他听说王汝贤入主长沙，代理督军职务，心里很不服气，竟然宣布常德独立，要攻夺长沙。两广援军也不肯听命王汝贤，纷纷反对。顿时长沙告急，到了十月十七号夜里，长沙忽然起火，烟雾漫天，秩序大乱。王汝贤只好弃城出走，也跑到岳州去了。那时候傅良佐和周肇祥因为擅离职守，已经被召入京城，听候查办。同时中央又有一道命令说：
据王汝贤等电称：傅督军于十四日夜，携印乘轮，不知去向，省长亦去，省城震动，人心惶恐。汝贤等为保护地方安全起见，会同在城文武，极力维持，现在秩序，幸保安宁等语。并据自请处分前来。傅良佐、周肇祥擅离职守，本日另有明令免职查办，长沙地方重要，不可主持无人，即派王汝贤以总司令代行督军职务，所有长沙地方治安，均由王汝贤督同范国璋完全负责。查王汝贤等，身任司令重寄，统驭无方，以致前敌败退，并擅发通电，妄言议和，本属咎有应得，姑念悔悟尚早，自请处分，心迹不无可原。此次维持长沙省城，尚能顾全大局，暂免置议。王汝贤等当深体中央弃瑕录用之意，严申约束，激励将士，将在湘逆军，迅予驱除，以赎前愆。倘再退缩畏葸，贻误戎机，军法俱在，懔之慎之！此令。
这道电文是十月十八号发来的，和王汝贤弃城逃走只隔了一晚。他仓皇出逃，没时间拍电报去京城，所以中央还不知道消息。
自从段祺瑞打算辞职后，对于湖南问题不想再过问了。冯总统正好可以自由下令，随便就把王、范的罪给豁免了。段祺瑞看到十八号的那份电文，更加不高兴了，心想老冯上回也是态度模糊，这次又只责罚傅、周，豁免王、范，分明是徇私舞弊，党同伐异。所以他又决定辞职，不想再和冯共事，正拟写第二封辞职信时，又接到直隶、湖北、江苏、江西四省的督军来电，请求撤兵停战。直隶督军曹锟、湖北督军王占元、江苏督军李纯、江西督军陈光远都是冯派的要员，一起给段总理施加压力。
箭在弦上，不得不发，停战是段总理不容许的。偏偏长江三位督军，联合直隶督军曹三爷，一起来反对段总理。段祺瑞非常恼火，当下递上第二封辞职信，不但辞去了总理，还把陆军总长的兼职一块辞了。冯总统假意挽留一番，只准他辞去兼职，不批准辞去总理。
段祺瑞本来是国务总理兼任陆军总长，有权有势。现在军权没了，还要总理这个虚的头衔干什么？当然全都推让了，打算离开京城。冯总统巴不得把他赶走，所以马上任命王士珍为陆军总长，汪大燮暂代总理。汪大燮是内阁的人，段总理既然不干了，他也想辞职，怎么好意思答应？王士珍并不参与党派，只因为他是直隶人，性情温和，资格最老，所以先前袁世凯和黎元洪都邀请他做总理。冯国璋见他无党无派，德高望重，又是老乡，想把他变为自己的帮手，抵制段派，调和南方。王士珍还算识时务，答应暂时代理。
