暗夜组织使用新研发的武器袭击正在举办婚礼的海上军人，杀死了其中八人。得知此情况的汪琦正在等柯林能够给神秘特工队送来信息。
贝尔找到柯林的父亲，希望能够拿回时光飞船，但是柯林的父亲并不同意，询问是谁要拿走时光，贝尔答应是时光主人，斯凯的爹不同意送走方尖碑，因为这是最后找回柯林的唯一希望。
时光主人召集时光塔人们开会，而时光塔主人正是会议主持人。时光主人将自己最新的计划公开，询问柯林父亲的意见，柯林父亲的回答让时光主人印象深刻。
柯林看着古画背后的符号，汪琦建议她去找贝尔揭秘。贝尔告知汪琦认识柯林的父亲。贝尔告诉画背后的符号是时光塔主人刻上去的。
黎影在暗夜组织大楼里看见柯林，柯林正将信息传送给神秘特工队，在一旁的贝尔看在眼里。
惠子怀疑柯林是外星人，这时候昊天打来电话约见汪琦。昊天来到实验室，直言实验室里有间谍，杰森被怀疑，但是最后在杰森的抽屉里找到了和暗夜组织联系的证据，杰森被带走。
昊天和汪琦见面，汪琦希望昊天能够将古画给他。昊天将杰森是暗夜组织间谍的照片给汪琦看。
由于柯林和杰森是实验伙伴，昊天怀疑是柯林栽赃给杰森。作为删掉照片的交换条件，贝尔想要带走柯林去见她的亲生父亲，汪琦并没有答应。看到此景，柯林想要冲出去阻止汪琦，但是惠子将她拦住。
汪琦将杰森的照片发给了神秘局的所有雇员，杰森被人追杀，没想到被卧底在神秘局的杨锐所救。
昊天眼看自己计划失败，想要投靠神神秘特工队，但是汪琦并不答应。汪琦希望贝尔能够将柯林父亲的地址告诉他，然后利用柯林设法接近时光主人。
柯林在地下室的地板上看到了她父亲的照片，汪琦赶来。在外面监视这一切的柯林父亲眼见自己的亲生女儿憎恨自己，怒火中烧。惠子回到神秘特工队，看见何岩，俩人终于团聚。而杨锐探员正是杰森之前的搭档，柯林想到自己的父亲抛弃了自己这么多年，柯林决定拒绝与父亲相认。
汪琦将自己画的符号显示给柯林看，柯林回应自己知道这符号背后的意义，其实是一幅地图。柯林的父亲来到神秘特工队见汪琦，把时光交给汪琦，希望能够联手毁掉暗夜组织。
