伏允可汗听说唐军杀到，慌忙从大帐后门逃出，催马狂奔，妻妾子女全都不管了。契苾何力挥着大刀杀进敌营，敌兵四散奔逃，只剩下伏允的妻妾子女抱在一起浑身发抖。契苾何力指挥手下把他们捆住，又缴获了二十多万头牲畜。李靖听说先锋打了胜仗，非常欣慰。两天之后，吐谷浑派使者来投降。李靖一询问，才知道伏允已经自杀，伏允的儿子慕容顺杀了天柱王，上表大唐，情愿投降。李靖命令加急上奏，太宗下诏封慕容顺为西平郡王，仍然统辖原来的部落。命令李大亮暂时留在原地作声援，李靖等人一律还朝。李靖与侯君集等人上朝交旨，太宗一一慰劳，论功犒赏。
没过多久，西平郡王慕容顺因懦弱无能，被族人杀掉。慕容顺的儿子诺曷钵还是个小孩子，吓得躲了起来才得以幸免。一时间大臣争权，国内大乱。太宗派李大亮、侯君集前往镇压，唐军很快剿灭了叛乱，为首作乱的几个贼人被正法，诺曷钵这才放心出来做了可汗。诺曷钵感念唐朝的大恩，向中原称臣，太宗封他为河源郡王。贞观十三年，诺曷钵亲自上朝拜见太宗，太宗喜爱他的恭顺，特地把女儿弘化公主嫁给他。诺曷钵非常感谢，带上公主高高兴兴地回国去了。
李靖出征吐谷浑的时候，唐朝遭遇了国丧。太上皇李渊在垂拱殿中病故，享年七十一岁。太宗因为守丧的缘故，不便临朝，特别命令皇太子李承乾暂时处理朝政。过了五月，太宗把太上皇葬在献陵，庙号高祖，谥号大武帝。筑陵的高度原来想仿照汉长陵，高九丈。秘书监虞世南上疏建议坟高三丈，以昭示太宗的节俭美德。房玄龄等人建议折中，按照汉光武帝墓的规格，以六丈为宜。太宗听取大臣的建议，修建了六丈的皇陵。下葬一年后，太宗才重新上朝。
不料半年之后，长孙皇后得了重病，而且一天比一天重。太宗心中很不安，命令太子李承乾守在母后身边。李承乾请求大赦天下，并要请和尚、道士进宫作法消灾。长孙皇后呵斥道：“生死由命，不是人力可以挽回的。如果修福真能延长寿命，那我平生并没有作恶，还用他们作法吗？况且大赦令关系到国家法典，佛、道都是远方的异教，都是皇上所反对的，怎么能因为我而乱了天下的法度呢？你千万不要乱来！”太子这才不敢上奏，只把这件事转告了房玄龄。房玄龄对太宗说起这件事，太宗赞叹不止。后来群臣又请求颁布特赦诏书，太宗有意批准，皇后听说后坚决反对，太宗这才没发诏书。正赶上房玄龄家里有事要回去处理，皇后当时已经病入膏肓，哭着跟太宗诀别：“房玄龄侍奉陛下多年，小心缜密，不愧是忠良之臣，如果没有大的变故，千万不要疏远他。我家本没什么功劳，因为嫁给陛下，才得到高官厚禄，无功受禄，最容易惹祸，陛下就不要再给我家人委以重任了。我一生没做什么贡献，死后不要厚葬，只要葬在山上就可以了。不要修坟茔，不要用厚棺椁，丧事的器物用瓦木就行了，一定要节约送终的费用，这样才不至于增添妾的罪过。希望陛下千万别忘了！”说到这，喘息了好一阵，才握住太宗的手道，“此后陛下处理朝政，一定要亲君子，远小人，接受忠谏，拒绝谗言，节省劳役，减少游猎，妾也就死而无恨了。”太宗听到这里不禁泪如雨下，只是向皇后点头，已经说不出话来。长孙皇后怕太宗过于伤心，也不再说话。第二天，长孙皇后与世长辞，享年只有三十六岁。
长孙皇后生性仁厚，对待其他妃嫔所生的儿子比自己亲生的还要好，后宫的妃嫔特别爱戴她。她经常用谦虚俭朴的道理训诫自己的儿子。皇后的大哥长孙无忌和太宗交情很好，太宗因为他立过很多功劳，封他为尚书仆射。皇后反而闷闷不乐，私下里让哥哥辞职。长孙无忌于是一再请求辞职，太宗不得已准奏，皇后这才高兴起来。太子李承乾的乳娘曾请求增加东宫的物资供应，皇后生气地说：“太子所担心的应该是自己无德无名，怎么能请求增加用度呢？”
皇后的女儿长乐公主下嫁给了长孙冲，太宗认为公主是皇后的亲生女儿，打算多陪嫁物品，比大公主还要多一倍。魏征进谏认为不妥，太宗很不高兴，告诉了皇后，皇后道：“妾曾经听陛下看重魏征，还不知道为什么，现在听了魏征的话，才知道他是在用礼义引导陛下，这才是真正的社稷之臣啊。”太宗听后，下令减少嫁妆，并赐给魏征四十匹布帛，四十万铜钱。皇后也派人赐给魏征厚礼，并且传懿旨说：“一直听说您正直，现在才得以证实，希望您一如既往直言上谏！”魏征从此更敢于大胆上谏了。有一天，太宗散朝后回到后宫，对皇后道：“朕一定要杀了这个种田出身的家伙。”皇后问哪个种田的，太宗回答：“就是魏征！他一天到晚絮絮叨叨，竟然当着满朝大臣的面让朕下不来台，只有杀了他才能解朕心头之恨。”皇后听完就退了出去，不一会儿穿着朝服进来下拜，并祝贺道：“妾听说，君主圣明大臣才正直，现在朝廷上有正直的大臣魏征，正说明陛下圣明啊。”太宗这才转怒为喜，还像往常一样对待魏征。长孙皇后平生最爱读书，曾经收集古代妇女得失的故事，整理成《女则》三十卷。皇后去世后，《女则》才由文官上奏太宗，太宗边读边哭，读完后举起书对近臣道：“皇后的这本书足以流传千古。朕从此在后宫听不到劝诫，失掉了一个好帮手，实在是不幸啊。”于是追封长孙皇后为文德皇后，葬在昭陵，太宗亲自写表作序，刻在陵旁。后来，太宗在宫中修了一座高楼，常常站在上面遥望昭陵，黯然泪下。
长孙皇后共生了三个儿子，一个是太子李承乾，一个是魏王李泰，另一个是晋王李治，李治就是后来的高宗皇帝。太宗怀念皇后，因而特别钟爱他们。魏王李泰礼贤下士，又擅长文学，太宗特别宠他，就命令他在府中设置文学馆，让他自己招学士讨论学问。谏臣感觉李泰的言行稍有不妥，太宗又命令王珪去当李泰的老师，并且对李泰说：“你对待王珪应当像对待朕一样。”李泰遵旨，每次见到王珪必然先下拜，王珪也颇有师道尊严，没有因李泰是皇子而自卑。师徒二人一个真教，一个真学，相得益彰。
太宗又让自己的儿子吴王李恪、齐王李祐、蜀王李愔、蒋王李恽、越王李贞、纪王李慎等人，分别担任各州的都督或者刺史。李恪为安州都督，经常外出游猎，侵扰居民，侍御史柳范上疏弹劾，李恪被免职。后来谏议大夫禇遂良上奏称：“皇子年轻，缺乏从政经验，不应当让他们掌管州事，不如留在京师，等教养成熟了再派往各州府治理百姓。”太宗虽然认为有道理，但也不过召回一两人罢了。
贞观十一年七月，连降大雨，洛河泛滥。洛阳宫进水，很多民居都被冲垮了，淹死六千多人。太宗下诏将所毁坏的宫室简单修缮，不能浪费，并撤掉明德宫内的玄圃院，把院中的材料赐给受灾的百姓。太宗命令百官上奏指出朝政过失，大臣们于是纷纷上疏，针砭时弊。魏征更是上了一份《十思疏》，堪称唐代大臣上疏中的经典，大致说道：
人君善始者实繁，克终者盖寡，岂取之易守之难乎？盖在殷忧，必竭诚以待下；既得志，则纵情以傲物。竭诚则胡越为一体，傲物则骨肉为行路。虽董之以严刑，振之以威怒，终苟免而不怀仁，貌恭而不心服。怨不在大，所畏惟人。载舟覆舟，所宜审慎。诚能见可欲，则思知足以自戒；将有作，则思知止以安人；念高危，则思谦冲而自牧；惧满盈，则思江海下百川；乐盘游，则思三驱以为度；忧懈怠，则思慎始而敬终；虑壅蔽，则思虚心以纳下；惧谗邪，则思正身以黜恶；恩所加，则思无因喜以谬赏；罚所及，则思无因怒而滥刑。总此十思，弘兹九得，简能而任之，择善而从之，则文武并用，可垂拱而治矣。
第二年又遭大旱，魏征再上《十渐疏》，直言不讳地指出了太宗内政外交上的种种过失，言辞非常恳切。太宗接受了这两份奏疏中的建议，并特别奖励了魏征。
魏征虽然忠心耿耿，却疏忽了太宗的一个大毛病。什么大毛病呢？好色。原来太宗生性好色，看见美貌女子，往往不肯放过，所以将弟媳杨氏及隋后萧氏全都收进了后宫。此外后宫妃嫔也是不可胜数。史传上记载着一个徐贤妃，说她五个月会说话，四岁通读《论语》、《诗经》，八岁能作文，到十几岁后，秀外慧中，才名卓著，太宗召为才人，又升为贤妃，始终宠眷不衰。还有吴王李恪的母亲，本来是隋炀帝的女儿，隋亡后辗转入宫，也深得恩宠。太宗仍不满足，还想选一些美人作为后半世的娱乐。上天也似乎恨他好色，特地生出了一个绝世佳人，让她来搅乱唐宫，闯出一场滔天大祸。这人是谁呢？就是大名鼎鼎的武则天。
武则天是并州文水人，父亲名叫武士彟，是唐高祖李渊的老朋友，官封光禄大夫，兼义原郡公，后来又升任工部尚书，加封应国公，历任利州、荆州都督。他的元配是相里氏，生下两个儿子，长子叫武元庆，次子叫武元爽。后来武士彟又娶杨氏，生下三个女儿，大女儿嫁给贺兰氏，青年守寡，次女就是武则天。则天并不是她在武家的名字，而是武氏篡夺大唐，改号为周以后，自称为则天皇帝。武则天的乳名已经失传。史书上说她叫做武曌，相传古时候并没有“曌”字，是由武氏杜撰出来的，用日月悬空自比，因此取名为“曌”。
武氏长到十四岁时，已经艳名远扬。太宗正留意物色，听说有这么个美人，便派人去召。她母亲杨氏突然接到诏书，不禁伤心流泪，武氏却谈笑自若，并且劝母亲道：“女儿能进宫见天子是好事啊，母亲哭什么呢？”母亲这才擦干眼泪，送她上路。到了京师，武则天进宫拜见太宗，竟然一点儿也不慌张，言谈举止非常得体。太宗仔细打量，真是面如芙蓉，体态婀娜，风情万种。等到黄昏时候，便召她侍寝。武氏虽然年纪小，却颇解风月之情，太宗越瞧越爱，就赐她一个芳名，叫做媚娘。第二天太宗直睡到日上三竿，轻轻叫了媚娘几声，武氏睁开惺忪的睡眼，连忙要起来谢恩，太宗已经走了。太宗上朝以后，当即下诏，册封武媚娘为才人，武媚娘当然谢恩。太宗让她住在福绥宫，又把那些年老的宫娥才女等全都放出。连从前高祖所宠的尹、张二妃也都让她们出宫归家。就是新近邀宠的萧后，也不再召幸，一心一意地爱恋起武媚娘来。
