张勋复辟到底还是太过仓促，事情办得都很草率，所有的手续也不完备，就是草诏中的各项事情也都是凭空捏造出来的，没有提前置办。其实，张勋并没有和冯国璋、陆荣廷等人接洽，草诏都是康有为和他两个人的杰作。
当时京城里面，按照张勋的命令，凡是办公局和大小商场全部悬挂龙旗，随风飘扬，好像还是以前的大清王朝，只有总统府里没有悬挂龙旗，张勋还算顾全黎总统的面子，没有动用武力，只是派清室旧臣梁鼎芬前往总统府做说客。
梁鼎芬见了黎总统后，将复辟的形势粗略地告诉他，并把一等公的封章取出来递给他。黎总统皱着眉头说：“我召见张定武进京，难道是让他来复辟的吗？”鼎芬说道：“这是天意，人心所向，张大帅不过是顺天应人，才有这次行动，况且黎公曾经也是前清官员，饱食清禄，辛亥政变也不是您的本意，天下人都清楚。前次公被迫上台，现在又被逼取消国会，公也是受尽了折磨，今天为什么不放下担子，安享富贵？既不会有愧于清室，又不必有愧于国民，不是一举两得吗？”黎总统说：“我并不是留恋总统职位，只是受到国民的委托，不敢不尽心尽力。如果复辟只是张少轩一个人的主张，恐怕中外人士都不会承认，我怎么敢私自允诺呢？”梁鼎芬又唠叨一会儿，见黎总统沉默无语，他便威胁说：“大清的天下，本来就应该归还给大清，公如果还是不为所动，一定会后悔的！”黎总统还是没说什么，梁鼎芬知道多说无益，就悻悻走了。
黎总统急忙命令秘书，将张勋复辟的情形和自己的立场拟写成三道电稿，由黎总统亲自查阅。因为电报局被定武军把守，他只好派心腹潜逃出城，赶到上海发布。
（第一电）本日张巡阅使率兵入城，实行复辟，断绝交通，派梁鼎芬等来府游说，元洪严词拒绝，誓不承认。副总统等拥护共和，当必有善后之策。特闻。
（第二电）天不悔祸，复辟实行，闻本日清室上谕，有元洪奏请归政等语，不胜骇异。吾国由专制为共和，实出五族人民之公意，元洪受国民付托之重，自当始终民国，不知其他。特此奉闻，藉免误会。
（第三电）国家不幸，患难相寻，前因宪法争持，恐启兵端，安徽督军张勋，愿任调停之责，由国务总理李经羲，主张招致入都，共商国是。甫至天津，首请解散国会，在京各员，屡次声称保全国家统一起见，委曲相从。刻正组织内阁，期速完成，以图补救。不料昨晚十二点钟，突接报告，张勋主张复辟，先将电报局派兵占领。今日梁鼎芬等入府，面称先朝旧物，应即归还等语。当经痛加责斥，逐出府外。风闻彼等已发出通电数道，何人名义，内容如何，概不得知。元洪负国民付托之重，本拟一俟内阁成立，秩序稍复，即行辞职以谢国人。今既枝节横生，张勋胆敢以一人之野心，破坏群力建造之邦基，即世界各国承认之国体，是果何事，敢卸仔肩？时局至此，诸公夙怀爱国，远过元洪，佇望迅即出师，共图讨贼，以期复我共和而救危亡，无任迫切。临电涕泣，不知所云。如有电复，即希由路透公司转交为盼。
黎总统派人去上海后，又和府里的心腹商量救急的方法，大家齐声说道：“现在京中的权利都在张勋一人手上，总统如果不答应他的要求，恐怕他会对总统采用极端手段，不如我们先考虑自救，暂时避难，等到外援到来，再做考虑。”黎总统说：“我要是一走，便不是总统了，怎么办？”大家还以为他留恋总统一职，就劝慰说：“这有什么，等到援兵到了，总统自然复位了。”黎总统摇头说：“我已经决定辞职，不愿意再担任总统了，只是一时没有办法交接，将来维持危局又靠谁？罢了罢了，我记得《约法》里，总统有意外时，副总统可以代行职权，看来只好交给冯副总统了。”
但是冯国璋远在江南，怎么交接？黎总统还是觉得为难，为了交接问题，几乎一夜没有合眼。大家也散去各自收拾行李，准备逃走。黎总统刚有点睡意，眯了一会儿，就被鸡叫吵醒了。黎总统便起床，吃完早餐后，还没有什么警报，只是有人传报，清宫里又任命一批大臣，有尚书、侍郎、左右丞、都统、提督、府尹等等。黎总统也没有心思仔细听，他还在担心交接问题。
到了中午，风声更加紧张了。下午，定武军竟然全副武装包围总统府，要求总统府卫队撤出，并立即交出印信，不得延迟。陆军中将唐仲寅是总统府卫队的统领，没有办法，只好报告总统，希望他能快点解决。
黎总统一直怀疑李经羲和张勋同谋，不愿意搭理李经羲。这次情况紧急，只好派秘书刘钟秀去邀请李经羲。不巧，李经羲正好派人递上了辞职的书信，去了天津。黎总统长叹说：“我也顾不那么多了，只好麻烦老段了。”于是命令刘钟秀起草两道命令，一是准许李经羲辞职，仍然由段祺瑞担任国务总理；二是请冯国璋代理总统权职，大总统的印信暂时交给国务总理段祺瑞保护，让他想办法转交给冯。两道命令盖过印章后，黎总统便派人将指令和印章一起送到天津，交给段祺瑞，自己带着唐仲寅、刘钟秀和一名仆从，偷偷溜出总统府，跑到东交民巷，往法国医院去，打算暂时避难。
黎元洪等人到达法国医院的时候，天已经黑了。虽然院门是开的，但是里面却只有几个打杂的，众人问他们院长去哪了，他们只说外出还没有回来。黎元洪一行人只好怏怏退出，几个人正流落街头，无家可归时，正好走到日本使馆，唐仲寅突然想起他和日本使馆的斋藤少将有点交情，可以向他寻求庇护。于是当下便派人前往斋藤的宿舍，递上名帖。
斋藤少将正好没有出门，立即出来迎接他们。斋藤少将本来就认识黎总统，又和唐仲寅有点交情，当然坦诚相待。仲寅把避难的情形大致地告诉他，并请他转达日本公使，恳请保护。斋藤少将一口答应下来，并命令手下好好招待他们，自己则前往使馆报告。黎元洪等人流落街头一天，一直没有吃饭，此时只能勉强吃了些日本食物，暂时充饥。没过一会儿，少将回来说道：“公使已经答应了，还请你们暂时在营房委屈几天，我会竭力保护的。”黎、唐二人当即表示感谢。斋藤少将随即命令卫兵腾出一间营房，供二人休息。黎总统从虎口逃生，算是不幸中的万幸了。第二天，日本公使通告驻京各国公使和清室：
黎大总统带侍卫武官陆军中将唐仲寅、秘书刘钟秀及从者一名，于七月二日午后九时半，不预先通知，突至日本使馆域内之使领武随员斋藤少将官舍，恳其保护身命。日本公使馆认为不得已之事情，并顾及国际通义，决定作相当之保护，即以使馆域内之营房，暂充黎总统居所，特此告知。
总统避难，国民垂危，冯国璋远在南京鞭长莫及，只有段祺瑞在天津，听说京城政变，迫不及待地想讨伐张勋。碰巧前司法总长梁启超也在天津，两人商议后，决定兴兵讨伐。陈光远正好驻扎在天津，手下有数千人，段、梁一起前往陈光远的军营，商讨讨伐张勋，陈光远也很赞成。李经羲回到天津后，写信给段祺瑞，希望他能挽回大局，同时黎总统派的亲信也送印信到达天津，交给段祺瑞。段祺瑞看完书信后，认为此次讨伐越来越名正言顺了，当即嘱托梁启超起草几道电文，陆续拍发出去。
梁启超是当代的大文豪，早已经洋洋洒洒地写了几十封信，通电全国，反对复辟。不过因为他手无寸铁，只是口头上的谴责。这回由段祺瑞出面，他更加理直气壮了，写得刚硬十足，大有横扫千军的气势。当即冯、段联约，段祺瑞自任共和军总司令，靠着那鸿篇大文，鼓吹义旅，笔伐凶豪。
