2012年，赵军忆上校带领异能突击队攻陷暗夜组织基地，缴获一大批不明物品，存档编号为49。现在，49号不明物品被暗夜组织抢走，新任神秘局局长昊天带领新的神秘特工队队员，欲从暗夜手中夺回49号。
上任不久，昊天派出几个手下执行任务，几个手下在执行任务的过程中遇到一个身份不明的杀手，杀手刀枪不入身手不凡，昊天的几个手下虽然个个身手了得，但还是没有抓住杀手。
杀手逃离现场的时候留下了一些不明物质，昊天的几个手下拾起不明物品返回基地报到。
一行人用刷脸当做通行，穿越基地设置的层层防御到达核心研发室，昊天只愿意跟柯林见上一面。
其它几个手下见柯林获得荣誉一样与昊天见面，人人脸上升起羡慕的神色，其中一人也想跟昊天见上一面。
柯林来到办公室中见到了昊天，昊天向柯林询问之前行动遇到神秘杀手的经过，神秘杀手刀枪不如非常了得，昊天暂时无法知道此人的姓名和背景身份，不过，神秘杀手被子弹击中的时候留下一些不明物品，昊天的一个手下经过化验，赫然发现不明物品分离出了一些特殊材质金属，金属自然来自神秘杀手，经过海量身份名单搜寻，神秘杀手的身份终于曝光。
此人名叫黎影是一名性格奇异人员，黎影拥有不凡的金属身体，因为在他小时候的时候他碰到过一架像石头一样的飞船，外表像石头一样普通，但是打开盖子里面却是，散发出银黄色的光芒，像是时光月亮，因为好奇，黎影就打开盖子躺了进去，没有想到时光飞船起飞了，里面的光芒随着移动速度和空间，在不断的变化，不同颜色相互交替，不知道过了多久，这个神秘的飞船落在了一个地方，而黎影也因此改变了他的人生，他的身体不再是普通血肉身体，外表渡了一层薄薄的特殊防护金属，任何东西都伤害不了。因为光芒吸引了，有特异功能的暗夜，暗夜顺着光芒寻找到了这个飞船，此后给飞船起名，“时光”，暗夜发现了特异能力的黎影，给黎影起名“影子”，此后黎影边跟随了暗夜，昊天与手下人研究黎影的时候，黎影正坐在家中不断寻找记忆中自己的身份。
经过一番摸底排查，昊天发现黎影会去晚宴袭击一名长官，长官接到神秘局的电话不以为然，提醒神秘局的人无需保护他，他的身边有许多身手不凡的保镖，对付一般的恐怖份子绰绰有余。
不过长官想错了，黎影不是一般的恐怖份子，他拥有特异能力不是凡人，长官身边的保镖根本不是黎影的对手。
虽然长官不愿意神秘局的人赶来保护他，但昊天还是派出几个手下火速赶往晚宴的现场，几人来到现场的时候正好遇到黎影袭击长官，几个名镖冲着黎影开枪，黎影却安然无恙抓起喷泉边的铁链向昊天的一个手下袭来，手下人打不过黎影迅速后退，另外几人趁机向黎影射出一种超强电流的针头。
黎影中针一瞬间无法动弹，强大的电流使他丧失了行动能力。
长官有惊无险被带回神秘局审讯，昊天来到审讯室亲自审讯长官。长官已经脱下军服，衣着普通如同一名囚犯被昊天审讯。
黎影逃出神盾局寻找充满神秘力量的物品，昊天派出几个手下来到一处河岸边寻找神秘物品。
柯林离开几个伙伴来到一处岸边旁边找到了神秘物品，潜伏在“时光”中的黎影现身抢夺神秘物品，柯林转过身子对着黎影的身子击出几拳，黎影平安无事站在当场。
柯林意识到黎影刀枪不入，心中升起一计转回身子拿出神秘物品想袭击黎影，黎影看着女队员拿起神秘物品，心中一紧就想后退，柯林拿着神秘物品忽然感受到一股强大的力量僵硬她的手臂，不等她回过神来，神秘物品发出银色光芒大有即将运行起飞之势，在黎影惊讶的目光中，柯林痛苦万分蹲在地上无法摆脱时光的强吸引力将她身体吸起空中，显然该物拥有吸食功能无法轻易甩掉。
其他队员闻讯赶了过来，黎影心知不能久留，赶紧转过身子逃走。队员们见柯林被神秘物品带走，众人赶紧离开河岸边带着队员往基地方向赶去，基地中有高科技设备的研究人员，队员回到基地才有解救柯林的希望。
负责送队员回基地的是一个男队员，几人坐在车上都很紧张焦虑，一个崩紧神精向基地方向开车。
汪琦等人无法承受神秘物品带走柯林的事实，心中对自己很失望，队友们非常理解他的心情，劝说汪琦再忍忍，只要赶到基地，基地一定可以有办法救回柯林。
让汪琦万万想不到的是，黎影忽然出现在公路中心挡住了汽车，汽车撞在克里尔身上车子倾斜，而黎影没有任何伤，黎影来到车外拿拾起神秘物品，在队友们恐惧的目光中扬长离去。
